肛肠科在何永恒教授、熊之焰教授、王真权副教授的带领下，以大肠肛门常见病、多发病、疑难病为重点，既继承传统优势，又不断探索创新，开发出系列专科专病的新疗法、新药物，其中大肠肛门病的诊治居全国一流水平、省内龙头地位。独特的诊疗技术深受广大患者欢迎，在国内享有盛誉。

该科2001年经卫生部批准为国家重点大肠肛门病专科。目前，科室拥有2个病区，88张病床，6间治疗室，3间手术室，配备奥林巴斯电子肠镜、电脑结肠途径治疗系统、电脑肛肠综合治疗仪、等离子肛肠病检查与治疗系统、冷光源肠镜检查系统、肛门直肠测压仪、手术心电监护系统等肛肠专科高精设备。科室现有教授4名，副教授3名，硕士研究生导师3名。科室的人才结构、学历结构日趋合理。多年来承担省、部级科研课题20余项，主编肛肠专著10余部，公开发表论文100余篇。该科在继承传统优势的同时，不断探索创新，首创了大肠癌的“手术加中药”治疗（双吻合技术+天马颗粒剂），保肛手术成功率及远期生存率和生活质量大大提高。首创了“高位复杂肛瘘开窗旷置术”等术式，将传统的“挂线”与现代的“微创”相结合，极大地保护了肛门直肠的组织结构、功能和外形。同时于2000年引进了“PPH术”等微创新术式，业务技术水平全国一流、湖南第一。该科自行研制的“天马颗粒剂”、“复方芩柏颗粒剂”、“熏洗灌肠液”、“麻仁丸（脾约丸）”、“生血通便颗粒剂”“保元肠疡灵冲剂”等十余种中药制剂广泛用于临床，在减轻患者痛苦、促进术后恢复、避免西药毒副作用等方面效果显著，深受同行认可及患者好评。