1、2006年3月16日，湖南中医药大学党委对我院党政班子进行调整：陈祥瑞任党委书记，肖四旺任代院长

2、我院新的综合目标责任制管理实施方案出台，于2006年5月正式实行。

3、4月，骨伤科床位扩编，增加一个病房单元，并分设了四肢关节、脊柱、手外、脑外、颈肩腰腿痛、康复按摩、传统骨伤治疗等七个三级学科。

4、4月，全省医药购销领域反商业贿赂专项治理工作在我院正式启动。4～6月为提高认识、学习教育阶段，7～9月为自查自纠阶段，10～12月为整改阶段。

5、5月，医院全体中层干部进行了年度述职测评。

6、6月8日，途径我院9条公交线路的站点更名为"省中医院"站，并提供了报站名服务。

7、6月16日，引进中国工程院石学敏院士"醒脑开窍"中风单元疗法新技术，聘请石学敏院士为我院首席专家，并成立了中风专科。

8、7月20日～8月20日，"冬病夏治-穴位敷贴"优质服务活动持续热烈开展，初伏当日门诊人次创历史新高。

9、7月我院PCR实验室技术通过国家卫生部临床检验中心验收合格。

10、7月25日，我院参加2006湖南医药博览会，甘霖副省长视察我院展位，对我院工作给予充分肯定。

11、7月，与长沙市开福区、天心区、雨花区、芙蓉区、岳麓区、高新区等六个区的卫生局新农合办签订了定点医院协议。年前与长沙县、浏阳市、平江县、桃江县的农合办也陆续签订了定点医院协议。

12、9月～11月，对医院网站进行了改版。皮肤科肛肠科、骨伤科、心血管内科、针灸科等5个专科网站陆续开通。

13、9月1日，中国针灸临床研究中心湖南分中心在我院挂牌暨中风专科新病房开业庆典隆重举行。

14、组织开展了6次大型院内义诊宣传活动，即：中风专科成立义诊、中风专科新病房开业义诊、冬病夏治优质服务活动义诊、肛肠专科肠癌普查义诊、皮肤肛肠专科迎检验收义诊、前列腺专科重阳节爱心义诊。

15、11月2～3日、皮肤、肛肠两个国家重点专科顺利通过国家中医药管理局评审验收。

16、2006年10月10日～2007年1月20日，我院在全院范围内开展"百日优质服务竞赛"活动。
   17、11月28日，湖南中瑞司法鉴定中心在我院挂牌成立。